凌宏清研究领域为小麦分子遗传学和植物营养分子生物学。其团队用模式植物拟南芥和番茄为研究体系，克隆了参与磷、铁吸收代谢关键基因20余个，系统地研究了植物吸收铁的分子调控网络，揭示了植物高效吸收铁的分子机理。2018年，该团队完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制，全面揭示了小麦A基因组的结构和表达特征，对深入和系统研究麦类植物的结构与功能基因组学以及进一步推动栽培小麦的遗传改良具有重要理论意义和实用价值。研究成果5月10日在《自然》在线发表。